Eine nosokomiale Infektion erfordert eine zusätzliche Diagnose und Behandlung, wodurch sich der Aufenthalt im Krankenhaus verlängern kann. In ernsthaften Fällen kann die Infektion zu längerer Invalidität oder sogar zum Todesfall führen. Oft handelt es sich dann um empfindliche und/oder schwer erkrankte Patienten, für die die zusätzliche nosokomiale Infektion eine sehr groβe Gefahr darstellt. Dies alles führt auch zu höheren Gesundheitskosten, sowohl für den Patienten als auch für die Gesellschaft.
Eine Studie des Federaal Kenniscentrum voor de Gezondheidszorg (KCE) hat gezeigt, dass nosokomiale Infektionen in Belgien jährlich für 720757 zusätzliche Krankenhausaufenthaltstage, 384.3 Millionen EUR zusätzliche Ausgaben für die Gesundheitspflege und 2625 zusätzliche Todesfälle verantwortlich sind.